斜め読みなんで他にも何かあるかもしれませんけど、
>続いて、ここのメールをヘッダーと本文に分割したいと思い
>調べてみたところ、
>「分かれ目には改行を使う」と言うのを見つけ
>下記のようなコードを書いてみました。
（略）
> for($k=$from;$k<$to;++$k) {
> //ここが質問の箇所です。ヘッダと本文の区切りをつけたい
> //その他、\r , \n も試してみました。
> if($file[$i]=="\r\n") { print "<hr>\n"; }
↑ここの$iは$kじゃないですか？
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UNO Shintaro, 宇野 信太郎
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