三村です。 2.0.1が組み込まれている場合にはphpinfo()の出力で2.0 or higherと表示されます。 phpのgdモジュールはlibgd.aをstatic linkしているので岡崎さんの環境では libgd.aが1.8.4のものになっているかgd-2.0.1のlibgd.aが/usr/local/lib以下に あって、先に/usr/lib/libgd.aが見つかってしまっているとかでしょう。 gd-1.8.4を完全に削除してしまえばうまくいくのではないでしょうか。