ジョナサンです。
下記のコードをwindows vistaで実行してみたが問題なく動きました。
> > <?php
> > output_add_rewrite_var('a', '1');
> > for ($i = 1; $i <= 2000; ++$i) {
> > printf("<a href=\"%04d.html\">%04d</a>\n", $i, $i);
> > }
> > -----
> >
>
php.ini パラメータ url_rewriter.tags
<http://www.php.net/manual/ja/session.configuration.php#ini.url-rewriter.tags>
あたりは変わった事ないですか？
ちなみに、phpは5.2.6です。