こんにちは，martinです。
深くは考えていませんが，タグを使っている場合は https?|ftp の直前に普通
「'|"」があるでしょうから，単に [^'\"] を追加して
$str = ereg_replace("[^'\"](https?|ftp)(://[[:alnum:]\+\$\;\?\.%,!#~*/:@&=_-]+)",
"<a href=\"\\1\\2\" target=\"_blank\">\\1\\2</a>",$str);
とでもすれば良いでしょうか。クォートなしに href=http:// ってされると困り
ますが，掲示板ならその指示を書いておけば良いですし。
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